Estou tentando fazer uma Cnc para confecção de pcbs, utilizando motores de passo de impressoras HP a parte mecânica está pronta e eletrônica também, estou utilizando um Arduíno uno com uma Cnc shield com Grbl ( https://github.com/grbl/grbl ) até aqui td bem.
O problema que encontrei é que o Arquivo Gerber que o Proteus Ares exporta não é compatível com o Gcode (achei que poderia ser a mesma coisa)
Você pode utilizar a transformação gerber no software Flatcam você define furos, fresa e corte e ele gera tudo em gcode para você, qualquer duvida eu ajudo você.