Como adicionar linhas de código do arduino em um botão no eclipse? Já configurei o arduino e o android no eclipse.

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   Cara não entendi direito o que você quer fazer, mas vamos lá (posso estar errado pois sou novato em arduino) mas creio que a comunicação entre o microcontrolador e a linguagem seja qual for pode ser feita via I/O através da porta serial do seu arduino. Por exemplo você pode criar um código em seu arduino que acenda um LED no pino digital 13 caso a serial (pino digital 01 receba o valor 1 ou seja quando o microcontrolador recebe 1 neste pino ele libera corrente no pino 13 acendendo o LED ligado a este pino. E caso o valor seja 0 o LED se apaga você corta a corrente no pino 13. Em seu código Java você deve criar um método utilizando Sockets I/O de forma que este botão se conecte a este método enviando o 1 ou o 0 para a porta serial do Arduino. Em teoria seria mais ou menos isso, porém nunca fiz na prática, usando um arduino. Ainda estou estudando =P

primeiro precisamos saber qual o tipo de comunicaçao de ambos se pelo wi-fi se pelo bluetooth ....

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