Garagista Bruno Dias Rosa

 

Garagista e veterinária Tiemi

 

Unindo os conhecimentos em veterinária da garagista Tiemi com os conhecimentos de programação do garagista Bruno, uma importante ferramenta está surgindo: um software para contagem de leucócitos que virá a acrescentar grande produtividade para os laboratórios veterinários, de pesquisa e, quem sabe, de humanos.


Atualmente, devido ao alto custo e à falta de confiabilidade dos resultados gerados pelos sistemas disponíveis, a maioria dos laboratórios requerem a contagem manual dessas células para inferir valores que auxiliam a determinação do perfil imunológico do indivíduo. Tais células são detectáveis através da visualização microscópica de lâminas com sangue corado.

 

Exemplo de imagem a ser processada (leucócitos em meio a dezenas de hemácias)

O software que está sendo desenvolvido com o apoio do Laboratório de Garagem, se utilizará de reconhecimento de imagens para encontrar as células de interesse e fornecer a contagem automaticamente, eliminando tempo precioso desperdiçado, além de falhas humanas e tendenciosidade no caso do pesquisador, aumentando produtividade e precisão aos resultados obtidos.

O Lab de Garagem deseja sucesso ao empreendimento!

 

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Comentário de Reynaldo J. A. Rizzo em 3 março 2011 às 20:37

Bruno e Adriana parabéns! é incrível ver uma aplicação destas. Eu sempre tive muito interesse pelos temas de biología e a natureza em geral, especialmente as aplicações tecnologicas para estes campos.

Se vocês tiverem mais idéias e precisarem de ajuda para desenvolver por favor avisem! quero conhecer e participar mais de projetos neste estilo.

Comentário de Bruno em 3 março 2011 às 15:22

Pessoal, a Tiemi me enviou essa resposta, ela não está conseguindo enviar pelo login dela.

 

Oi Pessoal!!

 

Fico animada que nossas idéias despertem interesse de tantas pessoas e toda ajuda ou sugestão é muito bem vinda...

 

Edmilson,

 

Agradeço o interesse e sua ajuda será muito bem vinda e aproveitada, pois de humanos eu só entendo a cabeça doida de certos proprietários dos animais... rsrsrsrsrs Felizmente sou pesquisadora, não lido mais com esse bicho-homem chamado proprietário... (brincadeira!!)

Falando sério... Acompanhe nossas atividades e nos ajude... Ainda estamos muito no campo das idéias e no começo do desenvolvimento... Mas com certeza será muito interessante sua colaboração!

 

Gente.... Só para desvendar algumas coisas que foram citadas...

As hemácias aparecem na foto em amarelo devido ao corante utilizado (Roseinfeld) e a iluminação do microscópio ... As hemácias são vermelhas naturalmente, por causa da hemoglobina... Mas a coloração que utilizamos "pinta" os leucócitos (neutrófilo, linfócito, etc) em diferentes tons de roxo, azul, rosa... Dependendo "do que tem dentro"....

 

Temos que contar uma a uma, pois o grande problema atual é que precisamos saber dentre os leucócitos, quantos são neutrófilos, quantos são linfócitos, quantos são eosinófilos, etc... Fazemos uma conta de porcentagem, e isso determina, ou auxilia a determinar, se o animal tem uma alergia, por exemplo, se está reagindo a um tipo de "agressão", etc....

 

Tivemos (eu e meu namorido Bruno) esta idéia pois no laboratório onde fico (USP) e em todos os que tenho conhecimento é utilizada a contagem manual... Um pesquisador senta no banquinho e fica horas contando lâminas.... Se houvesse algo automatizado, seria mais fácil, rápido, e em ciência ajudaria em um viés que existe: querendo ou não, a leitura pode se tornar tendenciosa, pois buscamos resultados... (Para isso temos que usar testes cegos). As máquinas que leem hemograma fazem essa contagem automática, mas não são confiáveis, então após passar o sangue na máquina, o pesquisador (ou técnico) tem que recontar na mão....

 

Se vcs começarem a se interessar por assuntos de biologia, vou me sentir menos "um peixe fora d'água".... rsrsrs

 

Abraço a todos!


Adriana Tiemi Akamine
Comentário de Albert Josuá em 3 março 2011 às 14:23
Que bacana.
Ponto para ciência.
Comentário de Bruno em 3 março 2011 às 13:09

Renato.

 

Obrigado pelo código, realmente uma imagem grande DEMORA!!!...rs...

 

Vou ver o que consigo fazer aki...


No site eu vi que tem um treinamento de redes neurais, é você quem ministra o curso ?

 

Passa os dados do curso ai, não achei no site.

 

Abraços

Comentário de Bruno em 3 março 2011 às 10:46

Marcelo

 

As amarelas são hemácias, as roxas são os leucócitos.

O tópico está aqui para isso mesmo, para todo mundo dar seus palpites, fique a vontade.

O reconhecimento de cada tipo de leucócito será feito por identificação de parâmetros, estou pensando em inteligência artificial para com o tempo ir aprendendo melhor sobres as células, mas isso ainda é bem pro futuro (não tenho conhecimento de IA para isso ainda).

 

Renato.

 

Esse teste que você fez, você pode me fornecer o código fonte ?

Pelo icone parece ser Visual Studio :D

 

Abraços

Comentário de Marcelo Amorim Menegali em 3 março 2011 às 0:42
Espera aí... os leucócitos são as bolinhas amarelas ou as vermelhas?
Pela legenda da imagem ("leucócitos em meio a dezenas de hemácias"), são as vermelhas.

E esse mapa de Kohonen parece ser poderoso mesmo. :)
Comentário de Edmilson Barbosa Moreira em 2 março 2011 às 23:15

OLá amiga garagista Tiemi, gostei desse software, pois trabalho na area  de medicina e gostaria muito de testar esse produto.

Se vc quizer posso ajudar na parte de consultoria.

Parabens pelo seu trabalh.

Comentário de Marcelo Amorim Menegali em 2 março 2011 às 18:18
Peço desculpas por ficar me metendo no seu projeto, hehehe. É que eu achei muito interessante e não consigo deixar de tentar pensar em soluções e de querer discutir.
Comentário de Marcelo Amorim Menegali em 2 março 2011 às 18:17

Vejo agora que eu tinha interpretado a imagem de forma errada. Pensei que os leucócitos fossem as bolinhas amarelas e as hemácias fossem as bolinhas vermelhas (talvez porque associei os glóbulos vermelhos à cor vermelha), mas na verdade é ao contrário.

 

Isso facilita as coisas, e muito, porque dá para passar um filtro de cor, daí fica muito mais fácil identificar as bolinhas vermelhas. Dá só uma olhada no que dá para fazer:

Fazendo algo assim, talvez nem precise identificar círculos na imagem. É só passar um filtro e identificar blobs vermelhos.

O problema daí fica restrito a essa classificação de leucócitos mesmo... como você está pensando em fazer? Fazer o computador classificar mesmo? Ou mostrar os leucócitos para o usuário, para que ele os classifique?

Pergunto isso porque são todos muito parecidos para mim.

Comentário de Bruno em 2 março 2011 às 17:57

Marcelo

 

A quantidade de problemas é muito maior.... além de identificar o que é um leucócito, ele vai ter que classificar esse leucócito em Monócito Linfócito Eosinófilo Macrófago e Neutrófilo.Além de não identificar o mesmo leucócito duas vezes (caso o usuário passe pelo mesmo lugar 2x), pois o que interessa é a porcentagem de cada tipo de célula. 

 

Achou que seria fácil ? heheheheheh

 

Pois é... não é nem de longe fácil, é um trabalho extenso e muito difícil de ser alcançado.

 

Abraços

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